Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RDH8Q9NYR8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RDH8Q9NYR8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms