Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD3AQ9NVI7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD3AQ9NVI7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD3AQ9NVI7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD3AQ9NVI7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD3AQ9NVI7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD3AQ9NVI7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD3AQ9NVI7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD3AQ9NVI7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD3AQ9NVI7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD3AQ9NVI7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD3AQ9NVI7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD3AQ9NVI7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD3AQ9NVI7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD3AQ9NVI7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD3AQ9NVI7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD3AQ9NVI7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD3AQ9NVI7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD3AQ9NVI7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD3AQ9NVI7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD3AQ9NVI7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD3AQ9NVI7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD3AQ9NVI7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD3AQ9NVI7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD3AQ9NVI7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD3AQ9NVI7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms