Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRT84Q9NSB2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms