Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMPRSS4Q9NRS4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMPRSS4Q9NRS4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms