Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPAG4Q9NPE6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPAG4Q9NPE6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms