Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM175Q9BSA9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms