Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNBD2Q96M20 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNBD2Q96M20 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNBD2Q96M20 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNBD2Q96M20 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNBD2Q96M20 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNBD2Q96M20 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNBD2Q96M20 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNBD2Q96M20 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNBD2Q96M20 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNBD2Q96M20 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNBD2Q96M20 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNBD2Q96M20 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNBD2Q96M20 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNBD2Q96M20 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNBD2Q96M20 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNBD2Q96M20 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNBD2Q96M20 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNBD2Q96M20 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CNBD2Q96M20 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CNBD2Q96M20 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms