Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCZQ96LD1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms