Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNFT2Q96EX2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms