Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTTNBP2Q8WZ74 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTTNBP2Q8WZ74 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms