Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNE4Q8N205 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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