Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J2

C16orf62, UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62Q7Z3J2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C16orf62Q7Z3J2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms