Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXD4L3Q6VB84 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms