Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC174Q6PII3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms