Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEZ8

PODNL1, Podocan-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODNL1Q6PEZ8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PODNL1Q6PEZ8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PODNL1Q6PEZ8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PODNL1Q6PEZ8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PODNL1Q6PEZ8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PODNL1Q6PEZ8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PODNL1Q6PEZ8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PODNL1Q6PEZ8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PODNL1Q6PEZ8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PODNL1Q6PEZ8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PODNL1Q6PEZ8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PODNL1Q6PEZ8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PODNL1Q6PEZ8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PODNL1Q6PEZ8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PODNL1Q6PEZ8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PODNL1Q6PEZ8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PODNL1Q6PEZ8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PODNL1Q6PEZ8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PODNL1Q6PEZ8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PODNL1Q6PEZ8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PODNL1Q6PEZ8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PODNL1Q6PEZ8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PODNL1Q6PEZ8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PODNL1Q6PEZ8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PODNL1Q6PEZ8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PODNL1Q6PEZ8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PODNL1Q6PEZ8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PODNL1Q6PEZ8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PODNL1Q6PEZ8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PODNL1Q6PEZ8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PODNL1Q6PEZ8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms