Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC39A12Q504Y0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms