Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KNOP1Q1ED39 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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