Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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