Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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PTPRNQ16849 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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PTPRNQ16849 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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PTPRNQ16849 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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PTPRNQ16849 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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PTPRNQ16849 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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PTPRNQ16849 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
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PTPRNQ16849 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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PTPRNQ16849 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRNQ16849 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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