Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLFQ16534 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLFQ16534 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLFQ16534 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLFQ16534 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLFQ16534 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HLFQ16534 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HLFQ16534 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLFQ16534 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLFQ16534 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLFQ16534 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLFQ16534 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HLFQ16534 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLFQ16534 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HLFQ16534 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLFQ16534 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLFQ16534 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLFQ16534 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLFQ16534 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLFQ16534 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLFQ16534 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLFQ16534 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLFQ16534 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLFQ16534 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLFQ16534 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLFQ16534 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLFQ16534 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLFQ16534 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLFQ16534 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLFQ16534 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLFQ16534 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLFQ16534 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HLFQ16534 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLFQ16534 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLFQ16534 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLFQ16534 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLFQ16534 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HLFQ16534 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HLFQ16534 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HLFQ16534 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HLFQ16534 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HLFQ16534 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLFQ16534 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLFQ16534 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLFQ16534 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLFQ16534 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLFQ16534 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLFQ16534 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLFQ16534 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLFQ16534 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLFQ16534 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLFQ16534 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLFQ16534 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLFQ16534 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLFQ16534 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLFQ16534 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLFQ16534 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLFQ16534 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HLFQ16534 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLFQ16534 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLFQ16534 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLFQ16534 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HLFQ16534 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLFQ16534 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLFQ16534 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLFQ16534 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLFQ16534 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLFQ16534 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLFQ16534 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLFQ16534 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLFQ16534 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms