Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC85BQ15834 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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