Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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