Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 KIAA1671-206ENST00000637069 6510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.021e-6■■■■□ 23.4
PCBP2Q15366 DGUOK-205ENST00000462685 715 ntTSL 312.54□□□□□ -0.42e-9■■■■□ 23.4
PCBP2Q15366 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.457e-8■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.37e-8■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.51e-7■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 FHL3-202ENST00000475084 882 ntTSL 517.54■□□□□ 0.41e-23■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.182e-10■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.191e-6■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.271e-6■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.387e-9■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 D2HGDH-212ENST00000468064 2298 ntTSL 1 (best)22.14■■□□□ 1.131e-6■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.573e-13■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 ASIC1-206ENST00000550558 3819 ntTSL 216.42■□□□□ 0.223e-9■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.13e-9■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.053e-9■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 FBXL18-202ENST00000415009 2526 ntTSL 214.97□□□□□ -0.013e-13■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 ASIC1-209ENST00000552633 614 ntTSL 514.47□□□□□ -0.093e-9■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.343e-13■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 ASIC1-208ENST00000552438 3327 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.723e-9■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.512e-8■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.422e-8■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 ATP1B1-203ENST00000494797 718 ntTSL 210.53□□□□□ -0.722e-8■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 CERS4-210ENST00000559490 420 ntTSL 520.24■□□□□ 0.833e-7■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.442e-14■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 MRPL4-211ENST00000592514 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 521.21■□□□□ 0.992e-14■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.572e-14■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.332e-14■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 PINK1-AS-201ENST00000451424 4443 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.971e-11■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.393e-7■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 CCDC14-211ENST00000463996 374 ntTSL 211.8□□□□□ -0.523e-7■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 CCDC14-207ENST00000433542 3260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.713e-7■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 CCDC14-201ENST00000310351 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.783e-7■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 CCDC14-222ENST00000495381 3993 ntTSL 29.38□□□□□ -0.913e-7■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 CCDC14-203ENST00000409697 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.093e-7■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 CCDC14-216ENST00000483247 697 ntTSL 37.06□□□□□ -1.283e-7■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 CCDC14-202ENST00000409657 3815 ntTSL 24.66□□□□□ -1.663e-7■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.773e-7■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.273e-7■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 LAMA5-213ENST00000497053 723 ntTSL 314.5□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.851e-9■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.361e-9■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.051e-9■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.321e-9■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 SMAD3-213ENST00000560175 542 ntTSL 412.46□□□□□ -0.417e-7■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.35e-10■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 PAPOLA-207ENST00000554130 848 ntTSL 520.71■□□□□ 0.915e-10■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 PAPOLA-205ENST00000553689 2267 ntTSL 1 (best)18.7■□□□□ 0.585e-10■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 PAPOLA-203ENST00000553357 585 ntTSL 516.35■□□□□ 0.215e-10■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.155e-10■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.175e-10■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 PAPOLA-221ENST00000556619 584 ntTSL 36.78□□□□□ -1.325e-10■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.75e-10■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 PAPOLA-210ENST00000554887 547 ntTSL 44□□□□□ -1.775e-10■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 PAPOLA-215ENST00000555626 2272 ntTSL 1 (best)3.8□□□□□ -1.85e-10■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.222e-12■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 ERAL1-203ENST00000461894 1628 ntTSL 1 (best)12.68□□□□□ -0.382e-12■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 ERAL1-208ENST00000583487 695 ntTSL 311.28□□□□□ -0.62e-12■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 ERAL1-204ENST00000471992 1508 ntTSL 58.93□□□□□ -0.982e-12■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.125e-8■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 AC011530.1-203ENST00000597712 432 ntTSL 213.88□□□□□ -0.195e-8■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 AC011530.1-204ENST00000595946 321 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.97□□□□□ -0.335e-8■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 AC011530.1-202ENST00000596586 397 ntAPPRIS P5 TSL 212.97□□□□□ -0.335e-8■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 GAK-207ENST00000505819 1326 ntTSL 520.15■□□□□ 0.821e-7■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 GAK-209ENST00000507580 468 ntTSL 419.62■□□□□ 0.731e-7■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.081e-7■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.111e-7■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.131e-7■■■■□ 23.3
PCBP2Q15366 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.453e-6■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.383e-6■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 ARNT-204ENST00000471844 3703 ntTSL 212.16□□□□□ -0.463e-6■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.283e-6■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 NPC1L1-204ENST00000546276 4826 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.524e-6■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 NPC1L1-202ENST00000381160 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.684e-6■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 NPC1L1-201ENST00000289547 5048 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.694e-6■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.062e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.542e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.026e-8■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 PKM-212ENST00000564440 3016 ntTSL 1 (best)8.77□□□□□ -1.012e-32■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.281e-6■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.271e-6■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.221e-6■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 11e-6■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.241e-6■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.091e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.451e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.451e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 P4HA1-202ENST00000307116 2727 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.731e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 P4HA1-203ENST00000373008 2727 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.731e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 FCGRT-211ENST00000598076 676 ntTSL 312.68□□□□□ -0.382e-10■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 TNFRSF1A-210ENST00000537842 404 ntTSL 32.81□□□□□ -1.965e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 SH3BP1-203ENST00000451997 3123 ntTSL 212.24□□□□□ -0.459e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 NSRP1-206ENST00000540900 2057 ntTSL 513.4□□□□□ -0.266e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 NSRP1-211ENST00000584154 583 ntTSL 310.93□□□□□ -0.666e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 NSRP1-201ENST00000247026 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.776e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 NSRP1-209ENST00000581048 547 ntTSL 49.58□□□□□ -0.886e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 NSRP1-208ENST00000580103 774 ntTSL 59.12□□□□□ -0.956e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 NSRP1-202ENST00000394826 1800 ntTSL 1 (best)8.77□□□□□ -1.016e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 NSRP1-207ENST00000577289 562 ntTSL 57.48□□□□□ -1.216e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 NSRP1-217ENST00000612959 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.236e-7■■■■□ 23.2
PCBP2Q15366 NSRP1-203ENST00000467446 548 ntTSL 36.69□□□□□ -1.346e-7■■■■□ 23.2
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