Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BECN1Q14457 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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BECN1Q14457 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BECN1Q14457 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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