Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EBI3Q14213 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
EBI3Q14213 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EBI3Q14213 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EBI3Q14213 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EBI3Q14213 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EBI3Q14213 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EBI3Q14213 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EBI3Q14213 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EBI3Q14213 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EBI3Q14213 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EBI3Q14213 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EBI3Q14213 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
EBI3Q14213 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
EBI3Q14213 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EBI3Q14213 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms