Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2H3Q13889 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF2H3Q13889 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms