Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTCH1Q13635 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTCH1Q13635 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms