Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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CUL4AQ13619 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
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CUL4AQ13619 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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CUL4AQ13619 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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