Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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NAE1Q13564 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NAE1Q13564 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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