Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LSAMPQ13449 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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