Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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