Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX10Q12887 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX10Q12887 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX10Q12887 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX10Q12887 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX10Q12887 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX10Q12887 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX10Q12887 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX10Q12887 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX10Q12887 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX10Q12887 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX10Q12887 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX10Q12887 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX10Q12887 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX10Q12887 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX10Q12887 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX10Q12887 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX10Q12887 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX10Q12887 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX10Q12887 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX10Q12887 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX10Q12887 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
COX10Q12887 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX10Q12887 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX10Q12887 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX10Q12887 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX10Q12887 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX10Q12887 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX10Q12887 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX10Q12887 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
COX10Q12887 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX10Q12887 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX10Q12887 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX10Q12887 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX10Q12887 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX10Q12887 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX10Q12887 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX10Q12887 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms