Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
STX4Q12846 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
STX4Q12846 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STX4Q12846 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
STX4Q12846 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STX4Q12846 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STX4Q12846 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STX4Q12846 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
STX4Q12846 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STX4Q12846 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STX4Q12846 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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STX4Q12846 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
STX4Q12846 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STX4Q12846 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
STX4Q12846 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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STX4Q12846 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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STX4Q12846 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STX4Q12846 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STX4Q12846 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
STX4Q12846 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
STX4Q12846 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STX4Q12846 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STX4Q12846 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
STX4Q12846 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
STX4Q12846 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
STX4Q12846 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STX4Q12846 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STX4Q12846 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
STX4Q12846 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STX4Q12846 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STX4Q12846 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
STX4Q12846 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
STX4Q12846 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
STX4Q12846 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
STX4Q12846 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
STX4Q12846 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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