Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCRN3Q0VDG4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms