Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C2orf54Q08AI8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C2orf54Q08AI8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms