Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA3Q08378 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA3Q08378 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms