Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EGR3Q06889 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms