Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EMX2Q04743 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms