Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLE4Q04727 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms