Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUCB1Q02818 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUCB1Q02818 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms