Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCNT1Q02742 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms