Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DSC2Q02487 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms