Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNFRSF17Q02223 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms