Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLCB3Q01970 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PLCB3Q01970 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms