Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms