Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSG4Q00888 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms