Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRX1P78414 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRX1P78414 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRX1P78414 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IRX1P78414 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IRX1P78414 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRX1P78414 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRX1P78414 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRX1P78414 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRX1P78414 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRX1P78414 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRX1P78414 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRX1P78414 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRX1P78414 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRX1P78414 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IRX1P78414 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IRX1P78414 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRX1P78414 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IRX1P78414 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRX1P78414 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRX1P78414 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms