Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB4BP68371 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms