Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA1P68133 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTA1P68133 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms