Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NCS1P62166 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NCS1P62166 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCS1P62166 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCS1P62166 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCS1P62166 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCS1P62166 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCS1P62166 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCS1P62166 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCS1P62166 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCS1P62166 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCS1P62166 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCS1P62166 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCS1P62166 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCS1P62166 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCS1P62166 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCS1P62166 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCS1P62166 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCS1P62166 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms